تمرینهای آموزشی کاوش آموز؛ یادگیری عملی علوم زیستی
در این صفحه به مجموعه تمرینهای مستقل و مرحلهبهمرحله دورههای کاوش آموز دسترسی دارید؛ از کار با پایگاههای داده و تحلیل توالی تا ژنتیک مولکولی، PCR، سیتوژنتیک و مهارتهای آزمایشگاهی. هر تمرین یک صفحه کامل دارد و علاوه بر راهنمای آموزشی، تمرین دورههای مختلف و پرسشهای منتخب دانشجویان را نیز در خود نگه میدارد.
تمرینهای فعال بیوانفورماتیک مقدماتی
در حال حاضر دو تمرین مستقل از دوره بیوانفورماتیک مقدماتی منتشر شده است. تمرین اول روی جستوجو و تفسیر واریانتها در Ensembl تمرکز دارد و تمرین دوم شما را وارد بررسی ساختار ژن، Transcriptها و Canonical Transcript میکند.
استخراج اطلاعات واریانت از Ensembl؛ آموزش rsID، MAF و ارتباط بالینی
در این تمرین، مسیر جستوجوی یک واریانت با rsID، یافتن موقعیت دقیق روی رفرنس GRCh38، بررسی فرکانس آللی و مطالعه ارتباط بالینی یا شرایط مرتبط با واریانت تمرین میشود. دانشجو در پایان، نتیجه بررسی خود را در بخش دیدگاههای همان صفحه ثبت میکند.
بررسی ساختار ژن در Ensembl؛ BRCA1، TP53 و CFTR
در تمرین دوم، دانشجو با استفاده از Ensembl ساختار سه ژن BRCA1، TP53 و CFTR را بررسی میکند؛ از Full Gene Name، Synonyms و Chromosomal Location تا Gene Length، تعداد Transcriptها، Canonical Transcript و تعداد Exon و Intron. پاسخ کامل در قالب Word ارسال میشود و انجام تمرین نیز در دیدگاههای صفحه ثبت خواهد شد.
تمرینها را بر اساس حوزه آموزشی پیدا کنید
این هاب فقط به بیوانفورماتیک محدود نیست. با انتشار تمرینهای جدید، هر حوزه به مجموعهای منظم از صفحات عملی تبدیل میشود.
بیوانفورماتیک
پایگاههای داده، تحلیل توالی، واریانت، طراحی پرایمر، BLAST و توالییابی سنگر.
ژنتیک مولکولی
استخراج DNA، کیفیتسنجی، آمادهسازی واکنش، بررسی جهش و رفع خطاهای آزمایش.
PCR و Real-Time PCR
طراحی واکنش، محاسبه مواد، برنامه حرارتی، تحلیل منحنی و Troubleshooting.
سیتوژنتیک
بررسی کروموزوم، تحلیل کاریوتایپ و تشخیص ناهنجاریهای عددی و ساختاری.
مهارتهای آزمایشگاهی
انتخاب تجهیزات، سمپلر، نمونهگیری، ایمنی، کنترل آلودگی و ثبت نتایج.
تفسیر دادههای ژنتیکی
بررسی واریانت، شواهد پایگاهها، ارتباط فنوتیپی و گزارشنویسی علمی.
همه تمرینهای کاوش آموز
از جستوجو یا فیلترها استفاده کنید. تمرینهای دارای برچسب «بهزودی» در برنامه انتشار قرار دارند.
استخراج اطلاعات واریانت از Ensembl
جستوجوی rsID، موقعیت روی GRCh38، فرکانس آللی، MAF و ارتباط بالینی واریانت.
بررسی ساختار ژن؛ BRCA1، TP53 و CFTR
بررسی نامهای ژن، موقعیت کروموزومی، Strand، طول ژن، Transcriptها، Canonical Transcript و تعداد Exon و Intron.
استخراج توالی مرجع ژن از NCBI
انتخاب رکورد مناسب، تشخیص RefSeq و دریافت توالی در قالب FASTA.
مقایسه Transcriptهای یک ژن
مقایسه اگزون، CDS و UTR و انتخاب ترنسکریپت مناسب برای هدف پژوهشی.
طراحی پرایمر برای یک Exon
انتخاب محدوده، طراحی پرایمر و بررسی اختصاصیت با Primer-BLAST.
تحلیل نتیجه BLAST
تفسیر Query Cover، Identity، E-value و Alignment برای انتخاب نتیجه مناسب.
بررسی کروماتوگرام توالییابی سنگر
ارزیابی کیفیت پیک، مقایسه با مرجع و شناسایی تغییرات احتمالی.
محاسبه و آمادهسازی واکنش PCR
محاسبه حجم مواد، تعداد واکنشها، Master Mix و کنترل خطای پیپتاژ.
تحلیل مقدماتی تصویر کاریوتایپ
شمارش کروموزومها و تشخیص اولیه ناهنجاریهای عددی یا ساختاری.
انتخاب تیوب و ویال مناسب برای نمونه
انتخاب ظرف مناسب براساس نوع نمونه، حجم، دما و مرحله آزمایش.
تمرینها چگونه به یادگیری کمک میکنند؟
هر صفحه تمرین هم برای دانشجوی دوره قابل استفاده است و هم برای کاربری که از طریق گوگل به دنبال یادگیری یک مهارت مشخص است.
مفهوم و مسیر کار را یاد بگیرید
پیش از حل تکلیف، تعریفها، ابزارها، مراحل انجام و خطاهای رایج را در راهنمای اصلی مطالعه میکنید.
سؤالهای دوره خود را حل کنید
در انتهای صفحه، بخش مربوط به ترم جاری قرار میگیرد و دانشجویان همان دوره سؤالهای مشخصشده را انجام میدهند.
از تجربه دورههای قبل استفاده کنید
سؤالهای دورههای پیشین، خطاهای پرتکرار و توضیحات آموزشی در آرشیو همان صفحه باقی میمانند.
پیش از شروع تمرین این نکات را بدانید
تفاوت میان محتوای عمومی تمرین و تکلیف مربوط به دورههای مختلف در پاسخهای زیر توضیح داده شده است.
آیا برای مشاهده تمرینها باید حساب کاربری داشته باشم؟
محتوای آموزشی و آرشیو عمومی تمرینها بدون نیاز به ورود قابل مشاهده است. شرایط ارسال پاسخ یا دریافت بازخورد ممکن است براساس دوره مربوط تعیین شود.
دانشجوی هر دوره چگونه سؤالهای کلاس خود را پیدا میکند؟
در بالای صفحه هر تمرین یک فهرست دسترسی قرار میگیرد و بخشهای هر ترم با عنوان و تاریخ مشخص از هم جدا میشوند. جدیدترین دوره در ابتدای بخش تمرینها نمایش داده میشود.
آیا سؤالهای دورههای قبلی حذف میشوند؟
خیر. سؤالهای دورههای پیشین در آرشیو همان صفحه باقی میمانند تا دانشجویان جدید بتوانند موضوعات و خطاهای رایج دورههای قبل را نیز بررسی کنند.
آیا پاسخ کامل همه دانشجویان عمومی منتشر میشود؟
خیر. تنها پرسشها یا پاسخهای آموزشی منتخب و پس از بررسی منتشر میشوند. اطلاعات شخصی، نمره و بازخورد اختصاصی دانشجو عمومی نخواهد شد.
آیا تمرینهای این صفحه فقط مربوط به بیوانفورماتیک است؟
خیر. این صفحه هاب عمومی تمام تمرینهای کاوش آموز است و تمرینهای ژنتیک مولکولی، PCR، سیتوژنتیک و مهارتهای آزمایشگاهی نیز به آن اضافه میشوند.
تمرین را شروع کنید؛ مسیر کامل یادگیری را در دوره ادامه دهید
صفحات تمرین برای شناخت مسیر و کار عملی طراحی شدهاند. برای آموزش منظم، بازخورد مدرس و انجام پروژههای کاملتر، دورههای حضوری و آفلاین کاوش آموز را بررسی کنید.